Az Intézet 2012. január 1-től az MTA Csillagászati és Földtudományi Kutatóközpontjában, Földtani és Geokémiai Intézet néven működik. A korábbi osztályszerkezet megszűnt, jelenleg a laboratóriumok mint funkcionális egységek, valamint két kutatócsoport (Archeometria KCs. és  Geokémia & Paleoklíma Kcs.) alkotják az intézet vázát.